PCR-SSCP(聚合酶鏈反應(yīng)-單鏈構(gòu)象多態(tài)性)分析技術(shù)是一種基于單鏈DNA構(gòu)象差別的快速、敏感、有效地檢測基因點突變的DNA多態(tài)方法。其基本原理是對已知有基因點突變的遺傳病，在其突變位點附近設(shè)計引物進行PCR擴增，將擴增的產(chǎn)物取出一部分（一般為1pl），變性后在不含變性劑的中性聚丙烯酰胺凝膠中電泳，由于單鏈DNA中堿基配對或聚集，當溫度或變性劑等環(huán)境改變會引起不同的構(gòu)象。 

      PCR產(chǎn)物稀釋倍數(shù)、甘油濃度、電壓、電泳溫度幾個重要的因素進行探討.方法:通過應(yīng)用PCR-SSCP方法結(jié)合核苷酸序列分析檢測成都漢族群體98個個體人類補體第8成分(C8A)基因型頻率分布.結(jié)果:凝膠濃度為8%,PCR產(chǎn)物稀釋4倍,上樣量為4μl,不加甘油,電壓為200V,恒溫電泳時,SSCP分析可得到滿意的結(jié)果.結(jié)論:PCR-SSCP分析對不同的研究對象,其分析參數(shù)不同,需要對其分析條件進行最大優(yōu)化,才能獲得實驗的成功.

      相同長度的單鏈DNA因其堿基順序不同，甚至單個堿基的差異會形成不同的構(gòu)象從而導(dǎo)致電泳時泳動速度不同。如靶DNA中發(fā)生堿基替代等改變時就會出現(xiàn)泳動變位，從而鑒別有無基因突變。例如，無過氧化氫酶癥是一種常染色體隱性遺傳病，患者過氧化氫酶活性只有正常人的0.2%~0.4%，雜合體血液中過氧化氫酶活性則處于中間水平。過氧化氫酶基因由13個外顯子和12個內(nèi)含子組成。應(yīng)用”P標記PCR反應(yīng)中底物方法，擴增第4個外顯子和內(nèi)含子附近的203bp片段，應(yīng)用SSCP法可清楚地判斷患者和雜合體。